Les débouchés portent sur les trois grands secteurs d'activité du mix énergétique du futur concernant le sous-sol  : (I) l'exploration de sites géothermiques et de stockage (techniques similaires à l'exploration pétrolière), incluant l'acceptabilité sociétale, (II) la caractérisation des réservoirs et des couvertures  (capacité de stockage, renouvellement de la chaleur), (III) la gestion de l'exploitation (monitoring) et des risques associés (forage, évolution du réservoir, risques de fuites et d'instabilité mécanique).

Le CMI donnant au bout de 5 ans un diplôme de master il est également possible de poursuivre en thèse à l’issue de la formation