La poursuite d'études en licence et/ou en école d'ingénieur est tout à fait possible. En effet, le BTS BioAlc valide les compétences qui sont des prérequis de la licence  : réaliser des analyses dans les différentes laboratoires, valider la conformité des résultats, rendre compte, proposer des améliorations de conduite d'analyse, appliquer les règles de sécurité et les risques biologiques et chimiques, etc. De plus, le volume horaire consacré aux disciplines générales permet de continuer à développer les qualités rédactionnelles et de synthèse essentielles à ce niveau d'études.