Le titulaire du BTS ABM est qualifié pour occuper un emploi de technicité élevée et d'une polyvalence large.

Son autonomie varie selon les tâches effectuées mais elle reste totale dans l’exécution des analyses et leurs validations techniques.

Il travaille essentiellement en plateaux techniques, au sein de centres hospitaliers, de centres de lutte contre le cancer, de sites de l’Établissement Français du Sang ou encore dans un service d'anatomocytopathologie.

Il peut également occuper un poste dans des laboratoires de ville.

Les secteurs de la recherche tels que les laboratoires universitaires ou industriels, l'Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), l'Institut Pasteur... ainsi que la médecine vétérinaire lui sont également accessibles.