Les titulaires du BTS Boqualité pourront occuper un emploi d’assistant dans un service QHSE (Qualité Sécurité Hygiène Environnement) et participer au système qualité d’une moyenne ou grande entreprise comme les agro-industries, les industries pharmaceutiques, et cosmétiques, la grande distribution, les administrations (services vétérinaires, AFFSSAPS...), hôpitaux et laboratoires d’analyses biomédicales… La qualité étant un concept transversal, il est également possible de postuler hors du domaine "biologie".

Dans les petites structures les techniciens qualité pourront occuper le poste de responsable QHSE. L’offre d’emploi est très vaste en raison des réglementations qui s’appliquent à ces secteurs et la sécurité du consommateur recherchée de façon accrue.