A la fin du premier semestre (fin janvier), les étudiants choisissent entre la filière PC (chimie renforcée et plus aucun enseignement de sciences industrielles de l'ingénieur) et la filière PSI (sciences industrielles de l'ingénieur renforcées et enseignement de chimie). Ce choix conditionnera l'entrée en seconde année (PC/PC\ ou PSI/PSI\).

Le lycée dispose en seconde année d'une classe de PC, d'une PC\* et d'une PSI.

Une possibilité est donnée aux étudiants souhaitant se réorienter en cours d'année (ou en fin de première année) de rejoindre l'université d'Aix-Marseille grâce à la convention signée entre les deux établissements, les étudiants de CPGE devant obligatoirement effectuer une double inscription dans une université.

A la fin de leur deuxième année, les étudiants passent les concours pour intégrer les écoles d'ingénieurs.