Le titulaire du BTS métiers des services à l'environnement MSE travaille dans des entreprises de services, des services généraux d'entreprises, des collectivités territoriales, des établissements publics ou administrations.

Il exerce principalement ses activités dans les secteurs de l'assainissement, de la gestion des déchets, de l'hygiène-propreté.

Les emplois peuvent avoir des intitulés différents selon les secteurs  : chef d'équipe ou chef de secteur d'entreprise de nettoyage ou d'assainissement, chargé d'études, animateur qualité/sécurité/environnement, adjoint au responsable des services généraux, technicien environnement des déchets.