Les débouchés du CMI ISI sont nombreux dans les métiers liés à l'acquisition, la gestion et l'analyse de données hétérogènes et massives dans les organisations qu'elles soient publiques ou privées. Les principaux métiers visés à l'issue du CMI ISI sont ceux de Data Scientist et Data Analyst dans des secteurs variés tels les banques, l'aéronautique, l'énergie, le transport, le biomédical et la santé, l'actuariat, le marketing et l'e-commerce, de l'industrie de la santé ou de l'environnement pour ne citer que ces quelques exemples. Les métiers dans le monde de la recherche en science des données ou en temps qu'ingénieur R&D orienté données que ce soit dans le public (par ex. CNRS, INRIA) ou dans des entreprises privées sont aussi envisageables.