Le débouché naturel de la licence SVT-E est le Master MEEF (Métiers de l'Enseignement, de l'Éducation et de la Formation) Second degré - Sciences de la vie et de la Terre, qui prépare au métier de professeur de l'enseignement secondaire.

D'autres masters destinés à former des enseignants sont également accessibles, comme le Master MEEF - Premier degré pour devenir professeur des écoles, ou encore les Masters MEEF Biotechnologies biochimie génie biologique ou Biotechnologies  : Santé et environnement qui ouvrent vers l'enseignement en baccalauréat technologique, BTS ou IUT).

La double compétence en Sciences de la Vie et Sciences de la Terre permet aussi d'accéder à certains Masters de Biologie (par exemple Biologie, Ecologie et Evolution ; Biologie végétale) ou de géosciences (Sciences de la Terre et des planètes, Environnement).